O BBS-Fiocruz está vinculado à Vice-Presidência de Pesquisa e Coleções Biológicas (VPPCB), tendo estreita colaboração com as Coleções Biológicas da Fiocruz, com a Rede Fiocruz de Biobancos e com demais laboratórios da Fiocruz. Além de ter o suporte de outras estruturas da Presidência da Fiocruz.
